イスラエルの攻撃は、イランの核備蓄施設を保護する遮蔽物を貫通しなかったという初期の兆候が見られる。国際原子力機関（IAEA）は、イランの主要なウラン濃縮施設で放射線レベルの上昇の兆候は見られなかったと述べた。イラン当局はIAEAに対し、テヘランの南約300キロに位置するナタンズ施設では、より高い放射線量は観測されていないと述べた。イスラエル当局は、ペルシャ湾岸にあるイランのブシェール原子力発電所への攻撃は行っていないと述べた。しかし、イスラエルのベンヤミン・ネタニヤフ首相は、「脅威が排除されるまで、必要な日数だけ攻撃を続ける」と述べた。イランのウラン濃縮施設を貫通できるのは、最も強力な通常兵器のみである。ナタンズ原子力施設は地下40メートル以上に建設されており、研究者らの推定によると厚さ約8メートルの鉄筋コンクリート製の殻で保護されている。フォルドゥ原子力施設では、濃縮施設は山の中に建設されている。 IAEAのグロッシ事務局長は最近の訪問後、ウラン濃縮施設は地下500メートルにあると推定した。